"In data stellare 43997 [31/12/2366, ore 03:31 ca., secondo la data terrestre - ndr - ], il capitano Jean-Luc Picard della nave della Federazione Enterprise, viene rapito per sei giorni da una forza di invasione di una razza conosciuta come "I Borg"; chirurgicamente alterato dai Borg, da questi, il capitano Picard viene costretto a comandare un attacco verso la Federazione, il primo scontro tra la Flotta ed i Borg, episodio tristemente noto con il nome de "la battaglia di Wolf 359": su 40 vascelli della Federazione, solo uno riuscì a rientrare al termine della battaglia contro il Cubo Borg, che, per altro, avanzò, diretto verso la Terra.
Tra i superstiti, quei pochi fortunati che non persero la vita come i rimanenti 11 mila federali, si annota il tenente comandante Benjamin Lafayette Sisko; nella battaglia, perde la moglie, deceduta in seguito alla distruzione della USS Saratoga; da quel momento in avanti, Sisko vedrà in Picard il responsabile del decesso della moglie, oltre ai rimanenti undicimila caduti in quel sistema.
Dopo tre anni dal tragico episodio, Sisko, promosso al grado di comandante, riceve l'incarico di comandante di stazione ed assegnato all'installazione Terok Nor, installazione cardassiana adesso sotto il governo provvisorio del pianeta Bajor, appena uscito dall'occupazione cardassiana ed in fase di ricostruzione e sulla via dell'unità ed integrazione nella Federazione Unita dei Pianeti; sulla ed intorno alla base, rinominata Deep Space Nine, si svolgono le vicende della serie, che dura sette anni, sia nel nostro tempo che in quello di Star Trek.
